Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX01

LMBR1L, Protein LMBR1L, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1LQ6UX01 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
LMBR1LQ6UX01 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms