Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 SPATA13-203ENST00000382108 8463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
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CSAG1Q6PB30 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 GRM4-206ENST00000544773 2983 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 SLC28A1-203ENST00000394573 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
CSAG1Q6PB30 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CSAG1Q6PB30 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CSAG1Q6PB30 ATL2-204ENST00000406122 2864 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CSAG1Q6PB30 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CSAG1Q6PB30 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CSAG1Q6PB30 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CSAG1Q6PB30 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CSAG1Q6PB30 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
CSAG1Q6PB30 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
CSAG1Q6PB30 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
CSAG1Q6PB30 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
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