Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms