Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CCDC38Q502W7 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCDC38Q502W7 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms