Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SP6Q3SY56 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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SP6Q3SY56 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SP6Q3SY56 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
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