Protein–RNA interactions for Protein: Q3L8U1

CHD9, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 9, humanhuman

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Length 2,897 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD9Q3L8U1 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD9Q3L8U1 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD9Q3L8U1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD9Q3L8U1 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD9Q3L8U1 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD9Q3L8U1 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD9Q3L8U1 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CHD9Q3L8U1 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 CXorf40A-205ENST00000423540 1208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 CD74-202ENST00000353334 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CHD9Q3L8U1 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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