Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
FSCN1Q16658 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms