Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SLC18A3Q16572 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC18A3Q16572 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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