Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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GABRA6Q16445 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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GABRA6Q16445 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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