Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
NPTX1Q15818 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
NPTX1Q15818 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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