Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ITSN1Q15811 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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