Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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