Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TRIM32Q13049 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRIM32Q13049 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.9 ms