Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CSTF3Q12996 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CSTF3Q12996 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms