Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
NFX1Q12986 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.9 ms