Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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RAB40BQ12829 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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RAB40BQ12829 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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RAB40BQ12829 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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RAB40BQ12829 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RAB40BQ12829 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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