Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NUP160Q12769 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
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