Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC15Q0P6D6 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms