Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC8.73□□□□□ -1.01
LRP1Q07954 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms