Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 PTGES3L-201ENST00000409446 1781 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ARHGDIB-201ENST00000228945 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 DUTP8-201ENST00000418412 489 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC007106.1-201ENST00000509666 600 ntTSL 4 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 BACH1-AS1-202ENST00000615718 700 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
TNP2Q05952 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 KCNMB3-201ENST00000314235 1485 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
TNP2Q05952 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms