Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms