Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms