Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
NHLH2Q02577 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms