Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
POU5F1Q01860 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms