Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms