Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CASP4P49662 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CASP4P49662 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms