Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NESP48681 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NESP48681 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NESP48681 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NESP48681 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NESP48681 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NESP48681 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NESP48681 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NESP48681 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NESP48681 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NESP48681 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NESP48681 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NESP48681 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NESP48681 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NESP48681 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NESP48681 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NESP48681 DYNLT1-201ENST00000367085 774 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NESP48681 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NESP48681 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NESP48681 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NESP48681 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NESP48681 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NESP48681 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NESP48681 MIR6125-201ENST00000618986 96 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NESP48681 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 AP003900.1-201ENST00000622592 859 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NESP48681 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 RNF212-201ENST00000333673 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NESP48681 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms