Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
GRIA4P48058 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
GRIA4P48058 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms