Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AL121949.1-201ENST00000402043 968 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AL121796.1-201ENST00000505702 466 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 RHOQP2-201ENST00000449922 579 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ATRXP46100 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ATRXP46100 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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