Protein–RNA interactions for Protein: P43652

AFM, Afamin, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFMP43652 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFMP43652 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AFMP43652 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFMP43652 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
AFMP43652 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFMP43652 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFMP43652 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFMP43652 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFMP43652 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFMP43652 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFMP43652 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFMP43652 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFMP43652 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFMP43652 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFMP43652 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFMP43652 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFMP43652 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
AFMP43652 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
AFMP43652 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
AFMP43652 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms