Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARL1P40616 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 WAPL-206ENST00000618527 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ARL1P40616 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms