Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CRABP1P29762 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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