Protein–RNA interactions for Protein: P23443

RPS6KB1, Ribosomal protein S6 kinase beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KB1P23443 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPS6KB1P23443 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms