Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNNI3P19429 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms