Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
DESP17661 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DESP17661 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DESP17661 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DESP17661 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DESP17661 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DESP17661 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DESP17661 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DESP17661 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DESP17661 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DESP17661 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DESP17661 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DESP17661 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DESP17661 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DESP17661 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DESP17661 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DESP17661 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
DESP17661 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DESP17661 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
DESP17661 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
DESP17661 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms