Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
EPCAMP16422 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms