Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TOP2AP11388 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms