Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ITGAVP06756 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ITGAVP06756 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms