Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
POLBP06746 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
POLBP06746 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms