Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PLXNC1O60486 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms