Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
MTSS1O43312 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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