Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CENPL-202ENST00000356198 2357 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBP-208ENST00000397866 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAPGEF4-AS1-202ENST00000435328 4625 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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