Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GOLGA6L9A6NEM1 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms