Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CCDC78A2IDD5 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms