Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 SYMPK-214ENST00000599814 6537 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
ARL2-SNX15V9GYD0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms