Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SNX13Q9Y5W8 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX13Q9Y5W8 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX13Q9Y5W8 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX13Q9Y5W8 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX13Q9Y5W8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX13Q9Y5W8 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX13Q9Y5W8 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX13Q9Y5W8 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX13Q9Y5W8 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX13Q9Y5W8 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SNX13Q9Y5W8 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SNX13Q9Y5W8 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX13Q9Y5W8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SNX13Q9Y5W8 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX13Q9Y5W8 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX13Q9Y5W8 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX13Q9Y5W8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX13Q9Y5W8 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX13Q9Y5W8 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX13Q9Y5W8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX13Q9Y5W8 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX13Q9Y5W8 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX13Q9Y5W8 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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