Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
YBX2Q9Y2T7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms