Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HPS5Q9UPZ3 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms