Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
MAPRE3Q9UPY8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MAPRE3Q9UPY8 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms