Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SHANK2Q9UPX8 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms